د پولیپټایډ پیپټایډ سلسلې ډیزاین سکیم او حل

I. لنډیز
پیپټایډونه ځانګړي میکرومولیکولونه دي لکه د دوی ترتیبونه په کیمیاوي او فزیکي ځانګړتیاو کې غیر معمولي دي.ځینې ​​​​پیپټایډونه ترکیب کول ګران دي ، پداسې حال کې چې نور یې ترکیب کول نسبتا اسانه دي مګر پاکول یې ګران دي.عملي ستونزه دا ده چې ډیری پیپټایډونه په اوبو کې یو څه محلول کیږي، نو زموږ په پاکولو کې، د هایدروفوبیک پیپټایډ اړونده برخه باید په غیر آبی محلولونو کې حل شي، نو له همدې امله، دا محلول یا بفرونه د کارولو سره په جدي ډول متضاد وي. د بیولوژیکي تجربوي پروسیجرونو، نو دا چې تخنیکان په کلکه د خپلو موخو لپاره د پیپټایډ کارولو څخه منع دي، نو لاندې د څیړونکو لپاره د پیپټایډونو ډیزاین څو اړخونه دي.

د پولیپټایډ پیپټایډ سلسلې ډیزاین سکیم او حل
دوهم، د مصنوعي ستونزمن پیپټایډونو سم انتخاب
1. د لاندې تنظیم شوي ترتیبونو ټول اوږدوالی
د 15 څخه لږ پاتې شونو پیپټایډونه ترلاسه کول اسانه دي ځکه چې د پیپټایډ اندازه ډیریږي او د خام محصول پاکوالی کمیږي.لکه څنګه چې د پیپټایډ سلسلې ټول اوږدوالی د 20 پاتې شونو څخه ډیریږي، د محصول دقیق مقدار یو مهم اندیښنه ده.په ډیری تجربو کې، د 20 څخه ښکته د پاتې شونو شمیر کمولو سره غیر متوقع اغیزې ترلاسه کول اسانه دي.
2. د هایدروفوبیک پاتې شونو شمیر کم کړئ
پیپټایډونه چې د هایدروفوبیک پاتې شونو لوی غالب شتون لري، په ځانګړې توګه د C-ټرمینس څخه د 7-12 پاتې شونو سیمه کې، معمولا د مصنوعي ستونزو لامل کیږي.دا په سمه توګه د ناکافي ترکیب په توګه لیدل کیږي ځکه چې د B-fold پاڼه په ترکیب کې ترلاسه کیږي."په داسې قضیو کې، دا ممکن ګټور وي چې له دوو څخه زیات مثبت او منفي پاتې شونو بدل کړي، یا د پیپټایډ جوړښت خلاصولو لپاره ګلی یا پرو پیپټایډ کې واچوي."
3. د "سختو" پاتې شونو کمول
"دلته یو شمیر Cys، Met، Arg، او Try پاتې شنې شتون لري چې عموما په اسانۍ سره نه ترکیب کیږي."سیر به عموما د Cys لپاره د غیر اکسیډیټ بدیل په توګه وکارول شي.
د پولیپټایډ پیپټایډ سلسلې ډیزاین سکیم او حل

دریم، په اوبو کې د محلول صحیح انتخاب ته وده ورکړئ
1. د N یا C ټرمینس تنظیم کړئ
د تیزابي پیپټایډونو سره تړاو لري (یعنې په pH 7 کې منفي چارج شوی) ، اسیتیلیشن (N-ټرمینس ایسټیلیشن ،C ټرمینس تل د وړیا کاربوکسیل ګروپ ساتي) په ځانګړي توګه د منفي چارج زیاتوالي لپاره وړاندیز کیږي.په هرصورت، د بنسټیزو پیپټایډونو لپاره (چې په pH 7 کې مثبت چارج شوی)، امینشن (په N-ټرمینس کې وړیا امینو ګروپ او په C-ټرمینس کې امینوشن) په ځانګړې توګه د مثبت چارج زیاتولو لپاره سپارښتنه کیږي.

2. ترتیب په پراخه توګه لنډ یا اوږد کړئ

ځینې ​​ترتیبونه د هایدروفوبیک امینو اسیدونو لوی شمیر لري لکه Trp، Phe، Val، Ile، Leu، Met، Tyr او Ala، او داسې نور. کله چې دا هایدروفوبیک پاتې شونه له 50٪ څخه زیات وي، معمولا په اسانۍ سره حل نشي.دا ممکن ګټور وي چې ترتیب اوږد کړي ترڅو د پیپټایډ مثبت او منفي قطبونه نور هم زیات کړي.دوهم انتخاب دا دی چې د پیپټایډ سلسلې اندازه کمه کړي ترڅو د هایدروفوبیک پاتې شونو په کمولو سره مثبت او منفي قطبونه زیات کړي.څومره چې د پیپټایډ سلسلې مثبت او منفي اړخونه قوي وي ، د اوبو سره عکس العمل ډیر احتمال لري.
3. په اوبو کې محلول شوي پاتې شونو کې واچوئ
د ځینې پیپټایډ زنځیرونو لپاره ، د ځینې مثبت او منفي امینو اسیدونو ترکیب کولی شي د اوبو محلول ښه کړي.زموږ شرکت وړاندیز کوي چې د اسیدیک پیپټایډونو N-terminus یا C-terminus د ګلو ګلو سره یوځای شي.د بنسټیز پیپټایډ د N یا C اصطلاح ورکړل شوی او بیا Lys-Lys.که چیرې چارج شوی ګروپ نشي کیښودل شي، Ser-Gly-Ser هم په N یا C ټرمینس کې کیښودل کیدی شي.په هرصورت، دا طریقه کار نه کوي کله چې د پیپټایډ سلسلې اړخونه بدل نشي.