ساختماني ځانګړتیاوې او د ټرانس میمبرین پیپټایډونو طبقه بندي

Cationic transmembrane peptides د لنډ پیپټایډونو څخه جوړ شوي دي چې په ارګینین، لیسین او هسټیډین کې بډایه دي، لکه TAT، Penetratin، Polyarginine، P22N، DPV3 او DPV6.د دوی په منځ کې، ارګینین ګیانیډین لري، کوم چې کولی شي د حجرو په غشا کې د منفي چارج شوي فاسفوریک اسید ګروپونو سره هایدروجن بانډ کړي او د فیزولوژیکي PH ارزښت په حالت کې د ټرانس میبرین پیپټایډونه په جھلی کې منځګړیتوب وکړي.د اولیګارجینین مطالعې (د 3 R څخه تر 12 R پورې) ښودلې چې د غشا د ننوتلو وړتیا یوازې هغه وخت ترلاسه کیږي کله چې د ارجینین اندازه 8 ته ټیټه وي، او د غشا د ننوتلو وړتیا په تدریجي ډول د ارګینین مقدار په زیاتوالي سره وده کوي.Lysine، که څه هم د ارګینین په څیر cationic، guanidine نلري، نو کله چې دا یوازې شتون ولري، د هغې د غشا د ننوتلو موثریت خورا لوړ نه وي.Futaki et al.(2001) وموندله چې د غشا د ننوتلو ښه اغیزه یوازې هغه وخت ترلاسه کیدی شي کله چې د cationic حجرو غشا د ننوتلو پیپټایډ لږترلږه 8 مثبت چارج شوي امینو اسیدونه ولري.که څه هم په مثبت ډول چارج شوي امینو اسیدونه د انفجار پیپټایډونو لپاره اړین دي چې غشا ته ننوځي، نور امینو اسیدونه په مساوي ډول مهم دي، لکه کله چې W14 په F کې بدلون ومومي، د Penetratin د ننوتلو وړتیا له لاسه ورکوي.

د cationic transmembrane peptides یوه ځانګړې طبقه د اټومي محلي کولو سلسله (NLSs) ده، کوم چې لنډ پیپټایډونه لري چې په ارګینین، لیسین او پرولین کې بډای دي او د اټومي پوستکي کمپلیکس له لارې نیوکلیوس ته لیږدول کیدی شي.NLSs نور هم په واحد او دوه ډوله ویشل کیدی شي، په ترتیب سره د لومړني امینو اسیدونو یو او دوه کلسترونه لري.د مثال په توګه، د سمین ویروس 40 (SV40) څخه PKKKRKV یو واحد ټایپ کولو NLS دی، پداسې حال کې چې اټومي پروټین دوه ځله ټایپ کولو NLS دی.KRPAATKKAGQAKKKL لنډ ترتیب دی چې کولی شي د میمبرین ټرانس میمبرین رول ولوبوي.ځکه چې ډیری NLSs د 8 څخه کم د چارج شمیره لري، NLSs اغیزمن ټرانس میمبرین پیپټایډونه ندي، مګر دوی کولی شي اغیزمن ټرانس میمبرین پیپټایډونه وي کله چې د هایدروفوبیک پیپټایډ سلسلې سره د امفیفیلیک ټرانس میمبرین پیپټایډونو رامینځته کولو لپاره په همغږۍ سره وصل شي.